SMKN 6 Manado telah meraih berbagai prestasi akademik dan non-akademik, baik di tingkat kota, provinsi, maupun nasional. Berikut adalah beberapa contoh prestasi yang dicapai oleh SMKN 6 Manado:
- Pada tahun 2013, tim putri SMKN 6 Manado menjuarai Hiking yang diikuti oleh sekolah-sekolah se-Sulawesi Utara.
- Pada tahun 2023, salah satu guru SMKN 6 Manado lolos untuk mengikuti Program Guru Penggerak yang diselenggarakan oleh Kemendikbudristek.
- Pada tahun 2023, SMKN 6 Manado berhasil meluncurkan Badan Layanan Usaha Daerah (BLUD) yang bertujuan untuk memasarkan produk-produk unggulan sekolah, seperti minuman herbal dari tanaman lokal.
- Pada tahun 2023, SMKN 6 Manado juga mengikuti berbagai pameran atau expo dengan menampilkan karya produk unggulan di Bahu Mall, Manado Town Square, dan sekolah-sekolah lainnya.
- Pada tahun 2024, SMKN 6 Manado mendapat Juara Dua pada Gerak Jalan yang diselenggarakan oleh Kwarcab Kota Manado dalam rangka Hari Ulang Tahun Republik Indonesia.
Selain itu, SMKN 6 Manado juga memiliki kerjasama dengan Jayadi Global Education Center (JGEC) untuk membuka kelas pelatihan khusus bagi mereka yang ingin bekerja di Jepang. Ini menunjukkan bahwa SMKN 6 Manado terus berinovasi dan berkreasi untuk meningkatkan kualitas pendidikan dan keterampilan peserta didiknya.